供熱企業管網建設費申請增值稅的操作方法如下：

1.登錄電子稅務局，進入電子稅務局后，點擊申報繳納。

2.進入納稅申報界面后，點擊該企業類型適用增值稅的申報表，填寫申報表。

3.小規模納稅人的增值稅免稅收入應填寫：10行或11行。

4.填寫申報單后，在表格末尾的“自我申報”部分選擇是或否。如果選擇是，則代表企業內部人員進行申報。選擇是否自己申報，然后填寫經辦人員的身份證號。

5、核對無誤后，點擊申報。